28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2834 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  68.71 
 
 		 312 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  51.58 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  49.83 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  41.35 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  43.81 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  41.86 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  44.1 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  41.18 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  42.95 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  43.26 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  43.26 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  43.26 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  42.63 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  39.63 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  34.22 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  32.81 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  28.26 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  30.51 
 
 		 242 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  23.66 
 
 		 254 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  31.49 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  26.82 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  39.18 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  30.93 
 
 		 509 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  24 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  28.72 
 
 		 208 aa  49.7  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  25.14 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>