91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2729 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  75.14 
 
 		 183 aa  278  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  62.9 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  60.22 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  60.96 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  59.89 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  56.28 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  56.83 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  56.83 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  56.83 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  57.98 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  54.64 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  54.64 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  54.64 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  59.89 
 
 		 189 aa  210  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  58.43 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  58.33 
 
 		 183 aa  207  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  56.11 
 
 		 183 aa  205  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  53.55 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  53.55 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  53.55 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  53.55 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  53.55 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  55.06 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  47.34 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  43.58 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  44.44 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  44.75 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.75 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  45.2 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  46.24 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  43.82 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  35.63 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  33.88 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.42 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  32.28 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  32.63 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  36.47 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.62 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  29.59 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  30.16 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.02 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  32.04 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  28.17 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.89 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  27.84 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4785  metallophosphoesterase  26.76 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.42 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  23.96 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.14 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.62 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  23.67 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  31 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 170 aa  48.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  30.95 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.4 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.61 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  32.47 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  25.74 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.11 
 
 		 232 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.18 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.75 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.7 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  37.84 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.36 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  35.14 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0272  metallophosphoesterase  29.87 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.664692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  30.43 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  23.53 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  30.67 
 
 		 272 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.06 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.63 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00810  Calcineurin-like phosphoesterase  32.22 
 
 		 307 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  24.87 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  24.4 
 
 		 259 aa  41.2  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  22.47 
 
 		 256 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.87 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>