More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2542 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  74.83 
 
 		 438 aa  666    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  76.16 
 
 		 433 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  75.46 
 
 		 433 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  75.93 
 
 		 433 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  76.87 
 
 		 433 aa  683    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  75.93 
 
 		 433 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 439 aa  886    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  76.39 
 
 		 433 aa  681    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  76.4 
 
 		 443 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  76.16 
 
 		 433 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  76.16 
 
 		 433 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  73.43 
 
 		 429 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  76.85 
 
 		 433 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  73.55 
 
 		 442 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  71.46 
 
 		 438 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  67.76 
 
 		 435 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  58.74 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  58.41 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  57.71 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  57.85 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  57.61 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  57.85 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  57.58 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  56.32 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  56.32 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  57.85 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  57.91 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  57.58 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  56.32 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  57.61 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 434 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 434 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 434 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  57.61 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  56.18 
 
 		 436 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 435 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  58.78 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  57.85 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  56.21 
 
 		 442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  55.97 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  53.95 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  54.31 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  55.48 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  52.2 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  52.36 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  54.55 
 
 		 428 aa  445  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  51.29 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  51.27 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  47.82 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  52.21 
 
 		 426 aa  415  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  47.74 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  52.25 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  47.69 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  48.25 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  48.95 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  47.81 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  48.26 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  47.45 
 
 		 867 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  46.64 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  47.32 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  47.17 
 
 		 867 aa  362  7.0000000000000005e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  43.5 
 
 		 852 aa  349  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  43.35 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  41.86 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  41.86 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  43.5 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  44 
 
 		 426 aa  320  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  43.46 
 
 		 429 aa  319  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  42.45 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  42.08 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  42.69 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  43.67 
 
 		 425 aa  312  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  40.37 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  43.69 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  41.88 
 
 		 430 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  41.99 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  40.28 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  40.51 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  43.03 
 
 		 428 aa  302  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  42.68 
 
 		 424 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  43.07 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 		 431 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  41.85 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.209889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>