More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2530 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  797    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.07 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.75 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  57.07 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  57.07 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.56 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.14 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.41 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  47.91 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  46.98 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.14 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.84 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.84 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.95 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.79 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.79 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.53 
 
 		 389 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.05 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.98 
 
 		 392 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 382 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  33.25 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.99 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.99 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.99 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.99 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  32.99 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.99 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 		 377 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.74 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.21 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  32.13 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.21 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  33.68 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 382 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  33.43 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  34.29 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 378 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.9 
 
 		 637 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  32.79 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  32.64 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  32.64 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  32.64 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  31.43 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  31.04 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  32.99 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>