More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2471 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.9 
 
 		 635 aa  709    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 635 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  57.12 
 
 		 635 aa  715    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  88.22 
 
 		 645 aa  1134    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  54.62 
 
 		 636 aa  680    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  85.29 
 
 		 639 aa  1056    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  50 
 
 		 645 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  100 
 
 		 638 aa  1305    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  81.56 
 
 		 640 aa  1056    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  54.91 
 
 		 637 aa  679    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  52.4 
 
 		 640 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  56.58 
 
 		 638 aa  702    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  61.56 
 
 		 636 aa  731    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  57.63 
 
 		 635 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  53.72 
 
 		 642 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  60.72 
 
 		 639 aa  768    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  77.76 
 
 		 638 aa  1008    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  57.05 
 
 		 635 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  56.03 
 
 		 634 aa  695    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  92.96 
 
 		 639 aa  1172    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  56.19 
 
 		 637 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  81.75 
 
 		 641 aa  1061    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  56.74 
 
 		 635 aa  708    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  56.9 
 
 		 635 aa  709    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  60.72 
 
 		 639 aa  772    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  55.33 
 
 		 635 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  56.9 
 
 		 635 aa  709    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  81.75 
 
 		 641 aa  1061    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  54.67 
 
 		 649 aa  689    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  81.56 
 
 		 640 aa  1033    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  52.55 
 
 		 646 aa  668    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  56.35 
 
 		 637 aa  736    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  81.75 
 
 		 641 aa  1061    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  81.44 
 
 		 641 aa  1055    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  57.79 
 
 		 635 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  53.01 
 
 		 647 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  81.75 
 
 		 641 aa  1061    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0797  ABC transporter ATPase component  56.25 
 
 		 644 aa  663    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  82.03 
 
 		 640 aa  1062    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  82.03 
 
 		 640 aa  1060    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  82.94 
 
 		 638 aa  1052    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  56.19 
 
 		 637 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  56.9 
 
 		 635 aa  709    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  81.88 
 
 		 640 aa  1059    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  58.31 
 
 		 639 aa  730    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  56.9 
 
 		 635 aa  709    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  52.67 
 
 		 631 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  50.62 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  49.53 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  48.39 
 
 		 650 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  50.39 
 
 		 623 aa  601  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  50.31 
 
 		 642 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  50.77 
 
 		 642 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  50.77 
 
 		 642 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  50.84 
 
 		 642 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  51.48 
 
 		 639 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  51.86 
 
 		 641 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 632 aa  589  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 632 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  49.16 
 
 		 645 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.97 
 
 		 653 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  49.45 
 
 		 627 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 637 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  47.34 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  46.79 
 
 		 648 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  46.71 
 
 		 648 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  47.27 
 
 		 641 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 		 636 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2140  ABC transporter ATP-binding protein  51.01 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  46.39 
 
 		 617 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  46.39 
 
 		 617 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  49.77 
 
 		 636 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  48.11 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  51.01 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  45.81 
 
 		 642 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  48.93 
 
 		 640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 		 615 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 637 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  46.36 
 
 		 649 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  46.2 
 
 		 649 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  46.87 
 
 		 641 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 633 aa  558  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  46.47 
 
 		 636 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  46.47 
 
 		 663 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  46 
 
 		 640 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  45.47 
 
 		 641 aa  558  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  45.43 
 
 		 649 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 648 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 648 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 641 aa  549  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 648 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  45.43 
 
 		 649 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  45.43 
 
 		 661 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 660 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  45.43 
 
 		 661 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 		 660 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  44.99 
 
 		 648 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>