More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2467 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1780  conserved hypothetical ATP-dependent protease  61.03 
 
 		 577 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000100505  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2604  ATP-dependent protease  60.86 
 
 		 577 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000149813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  58.72 
 
 		 577 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1638  ATP-dependent protease  59.62 
 
 		 577 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2679  ATP-dependent protease  60.86 
 
 		 577 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0066735  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  71.38 
 
 		 543 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000159451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2564  ATP-dependent protease  61.21 
 
 		 577 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000155632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2467  ATP-dependent protease  100 
 
 		 580 aa  1194    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00344984  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1818  ATP-dependent protease  59.66 
 
 		 569 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  55.04 
 
 		 599 aa  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000127268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  62.54 
 
 		 570 aa  719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  60.14 
 
 		 582 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  59.93 
 
 		 582 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000299604  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2655  ATP-dependent protease  56.97 
 
 		 596 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  59.41 
 
 		 582 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000644541  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  54.79 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000440956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  39.15 
 
 		 827 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  37.71 
 
 		 817 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  37.5 
 
 		 817 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  38.62 
 
 		 806 aa  283  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.88 
 
 		 802 aa  282  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  35.57 
 
 		 786 aa  283  9e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  37.74 
 
 		 829 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  38.51 
 
 		 575 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.01 
 
 		 816 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  35.94 
 
 		 786 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  33.19 
 
 		 831 aa  280  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.99 
 
 		 807 aa  280  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  37.33 
 
 		 800 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  37.17 
 
 		 811 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  36.96 
 
 		 811 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1598  hypothetical protein  34.28 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000947515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  37.07 
 
 		 546 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000734026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  37.16 
 
 		 809 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.5 
 
 		 843 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  35.88 
 
 		 832 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  34.33 
 
 		 803 aa  269  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  35.64 
 
 		 786 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  36.48 
 
 		 812 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  36.64 
 
 		 795 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.78 
 
 		 795 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  36.34 
 
 		 806 aa  266  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  39.55 
 
 		 590 aa  266  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164824  decreased coverage  0.000000603795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.62 
 
 		 806 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  36.04 
 
 		 802 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  34.54 
 
 		 818 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  36.05 
 
 		 812 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.93 
 
 		 805 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  37.07 
 
 		 799 aa  265  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  36.05 
 
 		 812 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  34.93 
 
 		 805 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  39.15 
 
 		 546 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  37.84 
 
 		 813 aa  264  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  35.08 
 
 		 811 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  36.05 
 
 		 812 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  34.45 
 
 		 811 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.31 
 
 		 805 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  36.38 
 
 		 791 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  36.57 
 
 		 815 aa  263  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  34.57 
 
 		 813 aa  263  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.7 
 
 		 805 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  33.81 
 
 		 821 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.47 
 
 		 801 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  35.46 
 
 		 798 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.87 
 
 		 812 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  39.3 
 
 		 583 aa  261  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000294909  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  39.3 
 
 		 583 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.3 
 
 		 865 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.81 
 
 		 810 aa  260  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  38.93 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  40.93 
 
 		 598 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  38.05 
 
 		 810 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  35.89 
 
 		 805 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  35.89 
 
 		 805 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  37.33 
 
 		 660 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.67 
 
 		 805 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  34.33 
 
 		 814 aa  256  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  32.42 
 
 		 808 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  33.33 
 
 		 819 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  33.54 
 
 		 861 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.12 
 
 		 805 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  32.23 
 
 		 825 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  36.26 
 
 		 784 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  37.53 
 
 		 803 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  36.94 
 
 		 589 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000072938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  34.42 
 
 		 817 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.8 
 
 		 788 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  38.86 
 
 		 819 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  35.27 
 
 		 777 aa  251  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  34.75 
 
 		 809 aa  251  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  37.78 
 
 		 589 aa  251  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  32.69 
 
 		 819 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.36 
 
 		 807 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  36.17 
 
 		 797 aa  248  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.5 
 
 		 813 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1467  putative ATP-dependent protease  34.42 
 
 		 586 aa  246  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000104055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  33.62 
 
 		 844 aa  246  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  30.8 
 
 		 798 aa  246  9e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  40.39 
 
 		 873 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  34.39 
 
 		 810 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>