131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2436 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  100 
 
 		 76 aa  153  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  73.61 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  60 
 
 		 73 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  57.75 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  54.17 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  54.17 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  54.17 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  54.17 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  53.62 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  48.61 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  48.61 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  54.17 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  48.61 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  45.83 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  48.57 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  45.07 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  41.67 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  36.76 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  42.37 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  35 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  28.57 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  31.94 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  39.29 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  31.25 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  38.18 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.84 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  29.31 
 
 		 189 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  42.59 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  37.1 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.04 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  42.59 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.36 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  41.82 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  36.36 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.36 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  41.82 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  32.84 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  35.29 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.36 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.36 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  38.24 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.82 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  31.94 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  41.18 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  30.91 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  41.3 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  31.67 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  29.41 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  35.29 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  31.75 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  28.57 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  38.89 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.62 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  41.18 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  22.86 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  28.57 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  28.57 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  29.03 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  36.54 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  38 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  36.36 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  34.55 
 
 		 75 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  30.26 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  40.38 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  36.54 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  36.54 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>