More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2423 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.27 
 
 		 356 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  85.67 
 
 		 356 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.27 
 
 		 356 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.73 
 
 		 356 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.55 
 
 		 356 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  89.89 
 
 		 356 aa  670    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  94.38 
 
 		 356 aa  705    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  740    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.39 
 
 		 356 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.11 
 
 		 356 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.45 
 
 		 356 aa  677    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.96 
 
 		 356 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.83 
 
 		 356 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  83.15 
 
 		 356 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  69.75 
 
 		 357 aa  542  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.86 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  52.66 
 
 		 614 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.04 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.67 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.78 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 		 388 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.04 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  28.04 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  27.03 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  28.86 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  27.7 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  28.86 
 
 		 395 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  28.86 
 
 		 395 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 		 378 aa  99.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  28.86 
 
 		 395 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  27.7 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  27.7 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  30.57 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  29.43 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  28.86 
 
 		 395 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.23 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.23 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.23 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.23 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.04 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  25.09 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  27.7 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.23 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.23 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  30.23 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 		 388 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2222  propanol dehydrogenase  28.25 
 
 		 370 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.806517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.42 
 
 		 395 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 		 397 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.63 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2175  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.02 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2388  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.02 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.83 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  27.36 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 		 385 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2229  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.02 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  28.14 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2275  propanol dehydrogenase  29.02 
 
 		 370 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0229422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>