More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2420 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  69.45 
 
 		 276 aa  427  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 		 276 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  65.58 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  66.18 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  65.45 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  65.45 
 
 		 276 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  63.04 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  63.41 
 
 		 276 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  62.41 
 
 		 277 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  62.32 
 
 		 276 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 		 280 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 		 284 aa  362  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  60.3 
 
 		 271 aa  344  8.999999999999999e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  58.8 
 
 		 275 aa  333  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  55.96 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  56.6 
 
 		 270 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  44.57 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.57 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  44.57 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  44.94 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.57 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  44.57 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  42.91 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 		 274 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  43.28 
 
 		 274 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  47.5 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  41.95 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  41.26 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  40.61 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.88 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.19 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.48 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.32 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  27.73 
 
 		 263 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.87 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 271 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.19 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.19 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.08 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.98 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.68 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  25.29 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.59 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.56 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 		 392 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  24.71 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>