More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2384 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  292  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  76.26 
 
 		 139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  71.94 
 
 		 139 aa  223  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  65.47 
 
 		 139 aa  206  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  66.19 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  65.47 
 
 		 148 aa  200  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  64.03 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  64.75 
 
 		 159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  66.19 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  61.87 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  64.03 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  61.87 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  63.04 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  62.59 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  61.87 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  57.55 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  64.03 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  59.71 
 
 		 139 aa  184  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  57.55 
 
 		 141 aa  183  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  58.82 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  58.99 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  58.82 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  57.55 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  55.4 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4608  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  175  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  55.4 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.147621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  55.4 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  56.83 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  58.27 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0693  protein of unknown function UPF0047  62.59 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  53.28 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4570  hypothetical protein  54.68 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  53.24 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  57.66 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  53.62 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  51.8 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  51.45 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4444  hypothetical protein  59.71 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.388057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  54.41 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  50 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4593  hypothetical protein  53.24 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4499  hypothetical protein  53.24 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4645  hypothetical protein  53.24 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.462887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4594  hypothetical protein  53.24 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4507  hypothetical protein  53.24 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  53.08 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  45.27 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2109  hypothetical protein  49.64 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  48.48 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  46.32 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  44.6 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  45.26 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  49.61 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  49.61 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  42.96 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  44.12 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  45.65 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  45.32 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  45.32 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  44.36 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  45.32 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  45.59 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  45.59 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  43.7 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  41.48 
 
 		 139 aa  121  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  44.53 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  44.36 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  43.07 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  50.94 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  48.25 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  43.8 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  42.4 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  47.58 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  41.48 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  42.11 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  42.11 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  42.11 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  44.7 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  40 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  41.35 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  45.24 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  43.75 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  46.49 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  39.85 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  40.3 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  40.88 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  47.12 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  43.75 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  41.48 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>