49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2373 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  907  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  78.12 
 
 
440 aa  696  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  37.62 
 
 
452 aa  315  1e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  38.9 
 
 
441 aa  313  3e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  37.41 
 
 
478 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  35.59 
 
 
469 aa  289  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  37.73 
 
 
435 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  36.41 
 
 
472 aa  285  1e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  35.49 
 
 
480 aa  283  3e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  34.93 
 
 
458 aa  283  3e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  38.11 
 
 
470 aa  283  3e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  35.15 
 
 
453 aa  283  4e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 
459 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  36.54 
 
 
437 aa  279  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  36.73 
 
 
436 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  36.73 
 
 
436 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  34.38 
 
 
468 aa  275  1e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16786e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  35.35 
 
 
456 aa  274  2e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  36.49 
 
 
436 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  36.53 
 
 
519 aa  273  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  34.51 
 
 
432 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  35.49 
 
 
435 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  36.41 
 
 
499 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  34.83 
 
 
432 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  31.52 
 
 
536 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  35.14 
 
 
441 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  33.65 
 
 
466 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  33.65 
 
 
466 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  33.65 
 
 
466 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  34.04 
 
 
538 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  32.37 
 
 
578 aa  255  1e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  34.84 
 
 
460 aa  255  1e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  34.84 
 
 
460 aa  254  2e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  34.84 
 
 
460 aa  254  2e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  34.12 
 
 
466 aa  253  5e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  33.88 
 
 
466 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  33.88 
 
 
466 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  34.58 
 
 
434 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  31.74 
 
 
538 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  33.41 
 
 
460 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  32.76 
 
 
427 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  31.74 
 
 
538 aa  245  1e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.35 
 
 
743 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  23.12 
 
 
700 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  33.33 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  46.51 
 
 
787 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  47.37 
 
 
613 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.37 
 
 
765 aa  43.5  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.91313e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0444  hypothetical protein  37.29 
 
 
183 aa  43.1  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>