66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2223 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  100 
 
 
275 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  77.45 
 
 
275 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  61.45 
 
 
290 aa  374  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  62.36 
 
 
275 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  56.18 
 
 
270 aa  322  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  56.55 
 
 
270 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  56.18 
 
 
270 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  55.26 
 
 
270 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  55.26 
 
 
270 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  55.26 
 
 
270 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  55.26 
 
 
270 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  55.26 
 
 
270 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  55.81 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  54.76 
 
 
255 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  50.37 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  48.82 
 
 
290 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  43.78 
 
 
293 aa  208  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.58 
 
 
286 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  41.29 
 
 
267 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  46.19 
 
 
237 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  42.73 
 
 
245 aa  195  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  44.84 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  40.91 
 
 
259 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  42.67 
 
 
288 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  42.99 
 
 
294 aa  175  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  45.97 
 
 
310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  38.06 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  42.33 
 
 
250 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  36.79 
 
 
330 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  42.65 
 
 
354 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  42.79 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.38 
 
 
320 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  40.69 
 
 
297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.39 
 
 
239 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.38 
 
 
293 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  38.28 
 
 
301 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  40.8 
 
 
353 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  35.93 
 
 
274 aa  122  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  41.38 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  35.65 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  35.65 
 
 
274 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  35.65 
 
 
274 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  35.65 
 
 
274 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  35.65 
 
 
274 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.65 
 
 
274 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  35.65 
 
 
274 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  35.22 
 
 
274 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  35.5 
 
 
307 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  35.5 
 
 
307 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  35.5 
 
 
307 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  35.5 
 
 
307 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  35.5 
 
 
307 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  36 
 
 
278 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  30.49 
 
 
243 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  27.72 
 
 
243 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  38.73 
 
 
302 aa  99.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  30.36 
 
 
244 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  31.86 
 
 
322 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.54 
 
 
223 aa  96.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  36.72 
 
 
257 aa  95.5  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  28.16 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  38.85 
 
 
174 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  35.15 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  31.39 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.59 
 
 
74 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02069  uncharacterized FlgJ-related protein  37.04 
 
 
150 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0320569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>