20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2094 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  38.07 
 
 		 175 aa  88.6  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  29.56 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  34.81 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  31.67 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  31.98 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.12 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  28.84 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  31.03 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  26.92 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  27.12 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  25.37 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  27.1 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  25.34 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  25.76 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  32.29 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3137  hypothetical protein  32.63 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0172  hypothetical protein  27.91 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>