275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1942 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  56.2 
 
 
673 aa  791    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  100 
 
 
670 aa  1392    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  55.77 
 
 
667 aa  759    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  51.84 
 
 
677 aa  744    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  56.13 
 
 
677 aa  799    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  60.32 
 
 
677 aa  839    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  55.99 
 
 
680 aa  790    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  48.6 
 
 
677 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  53.19 
 
 
674 aa  745    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  87.16 
 
 
670 aa  1231    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  48.03 
 
 
678 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  58.43 
 
 
679 aa  824    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  43.93 
 
 
674 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  46.19 
 
 
668 aa  611  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  43.71 
 
 
663 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  44.69 
 
 
690 aa  588  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  44.05 
 
 
690 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  43.35 
 
 
714 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  41.59 
 
 
665 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  40.15 
 
 
667 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  39.11 
 
 
670 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  39.91 
 
 
667 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  39.64 
 
 
670 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  42.05 
 
 
668 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  39.79 
 
 
704 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  41.1 
 
 
667 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  40.94 
 
 
667 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  37.31 
 
 
650 aa  472  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  38.16 
 
 
711 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  40.3 
 
 
745 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  36.01 
 
 
705 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.06 
 
 
594 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.7 
 
 
588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.31 
 
 
550 aa  163  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  28.95 
 
 
571 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.06 
 
 
595 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.56 
 
 
625 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.71 
 
 
647 aa  157  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.49 
 
 
534 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  28.26 
 
 
644 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  26.1 
 
 
553 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  26.36 
 
 
668 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  25.14 
 
 
542 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.69 
 
 
611 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  27.37 
 
 
595 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  27.13 
 
 
612 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  26.01 
 
 
668 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  26.94 
 
 
576 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.88 
 
 
576 aa  133  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  24.21 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  24.44 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  26.49 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  24.63 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.26 
 
 
561 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.79 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  25.09 
 
 
615 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  25.7 
 
 
673 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  26.26 
 
 
549 aa  126  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.3 
 
 
587 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.92 
 
 
585 aa  125  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  24.47 
 
 
547 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  27.72 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  24.06 
 
 
686 aa  117  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.72 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.3 
 
 
534 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.12 
 
 
580 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.91 
 
 
550 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  25.56 
 
 
638 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.62 
 
 
545 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  22.41 
 
 
617 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  22.53 
 
 
636 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.39 
 
 
546 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  23.93 
 
 
655 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  25.32 
 
 
529 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.64 
 
 
577 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.4 
 
 
570 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.74 
 
 
645 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.22 
 
 
653 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.29 
 
 
568 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  24.66 
 
 
544 aa  108  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  24.17 
 
 
545 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  23.95 
 
 
637 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  24.95 
 
 
558 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  23.42 
 
 
618 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  24.1 
 
 
630 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  24.29 
 
 
625 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  30.26 
 
 
499 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.66 
 
 
605 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  24.2 
 
 
641 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  24.88 
 
 
571 aa  101  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  23.19 
 
 
641 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  23.71 
 
 
627 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  23.24 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  23.38 
 
 
700 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  24.3 
 
 
537 aa  96.3  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  28.62 
 
 
503 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  25.58 
 
 
558 aa  94  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  24.32 
 
 
551 aa  94  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.6 
 
 
629 aa  94  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  24.32 
 
 
551 aa  94  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>