More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1868 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  89.21 
 
 		 142 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  85 
 
 		 141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  85.51 
 
 		 149 aa  248  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  83.22 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  87.79 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  87.79 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  87.79 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  82.98 
 
 		 141 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  86.15 
 
 		 154 aa  237  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  86.15 
 
 		 154 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  86.15 
 
 		 154 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  85.82 
 
 		 145 aa  236  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  83.33 
 
 		 142 aa  236  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  86.82 
 
 		 154 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  86.92 
 
 		 143 aa  234  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  64.12 
 
 		 135 aa  183  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  64.84 
 
 		 135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  64.84 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  63.57 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  63.57 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  65.08 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  64.06 
 
 		 135 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  65.12 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  60.8 
 
 		 131 aa  166  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  56.8 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  57.81 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  58.87 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  56.45 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  52 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  46.61 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  46.61 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  47.32 
 
 		 263 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  40.18 
 
 		 265 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.52 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 260 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 176 aa  88.6  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  36.07 
 
 		 176 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  36.07 
 
 		 176 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  42.2 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 175 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  38.66 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.58 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.5 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.5 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  39.5 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  39.5 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.5 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.5 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.66 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.66 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.71 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.66 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  31.78 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  31.78 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.28 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  33.33 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  34.23 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  34.23 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>