More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1854 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  93.45 
 
 		 229 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.39 
 
 		 229 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  87.77 
 
 		 229 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.94 
 
 		 228 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  82.38 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  82.38 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  82.38 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.38 
 
 		 228 aa  387  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.5 
 
 		 228 aa  384  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  81.94 
 
 		 228 aa  384  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.5 
 
 		 228 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.5 
 
 		 228 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  80.18 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  80.18 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  76.65 
 
 		 229 aa  337  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  65.2 
 
 		 228 aa  307  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  61.33 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  61.33 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  62.56 
 
 		 232 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  61.16 
 
 		 228 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63 
 
 		 227 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  61.82 
 
 		 224 aa  298  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  60.99 
 
 		 225 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  61.4 
 
 		 228 aa  297  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  60.71 
 
 		 228 aa  297  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  60.99 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  61.67 
 
 		 227 aa  294  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  59.82 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  59.03 
 
 		 227 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  60.09 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  60.09 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  60.09 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  60.09 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  60.09 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  59.65 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.79 
 
 		 236 aa  289  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  59.47 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.62 
 
 		 211 aa  280  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  65.45 
 
 		 229 aa  278  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  57.78 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.31 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  57.08 
 
 		 227 aa  265  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  58.45 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.38 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.07 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  56.76 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  56.76 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  54.55 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.55 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  54.98 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  54.98 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.96 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  54.98 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  54.98 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.78 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  53.71 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  57.46 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  56.31 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  52.19 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  52.19 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.04 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  53.18 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  53.18 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  50.88 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.05 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  52.29 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  52.61 
 
 		 224 aa  224  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  52.61 
 
 		 224 aa  224  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  52.94 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  50.68 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  50.68 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  50.68 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.68 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  50.68 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  50.68 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.68 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  50.68 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.92 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  51.36 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.86 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  50.68 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  48.85 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  47.71 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.68 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  51.12 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  49.12 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  50.68 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.68 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.68 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  50.68 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>