228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1818 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 397 aa  821    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  48.29 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  43.9 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.43 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  40.46 
 
 		 483 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.77 
 
 		 393 aa  279  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  42.78 
 
 		 420 aa  275  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.79 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  42.41 
 
 		 708 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  42.12 
 
 		 730 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.83 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  41.48 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  42.12 
 
 		 730 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  43.23 
 
 		 473 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  41.26 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.94 
 
 		 472 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  42.94 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  44.81 
 
 		 457 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  40.34 
 
 		 435 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  41.62 
 
 		 416 aa  262  8.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.65 
 
 		 472 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  41.83 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.93 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.67 
 
 		 413 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  43.97 
 
 		 375 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.4 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.51 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  42.86 
 
 		 527 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.57 
 
 		 437 aa  256  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.51 
 
 		 415 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.01 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.63 
 
 		 422 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  38.97 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.97 
 
 		 440 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.41 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  41.6 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.46 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.51 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.94 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.33 
 
 		 433 aa  249  8e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.56 
 
 		 436 aa  249  8e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.66 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  41.89 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.46 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.55 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.11 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.4 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.46 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.87 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.59 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  37.54 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
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NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.94 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
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NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.32 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  39.53 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  36.89 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.36 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.08 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  37.62 
 
 		 439 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.14 
 
 		 413 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  36.29 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.95 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.46 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.58 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.86 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.57 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.83 
 
 		 347 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.46 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  36.99 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  37.46 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.51 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.69 
 
 		 341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  34.29 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.84 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.63 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.57 
 
 		 374 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.13 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.03 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.43 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.74 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  34.11 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  37.23 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.53 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  34.55 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.11 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.44 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.17 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  35.76 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  36.24 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.9 
 
 		 353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.55 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
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