More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1714 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  76.45 
 
 		 481 aa  725    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 		 483 aa  957    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  71.73 
 
 		 479 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  46.37 
 
 		 484 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  46.37 
 
 		 484 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  46.37 
 
 		 484 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  43.13 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  43.72 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  45.12 
 
 		 483 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  43.54 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  42.76 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  43.33 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  44.37 
 
 		 483 aa  360  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  43.33 
 
 		 483 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  41.95 
 
 		 483 aa  359  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  43.33 
 
 		 483 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  43.11 
 
 		 483 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  42.99 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  41.21 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  42.3 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  40.42 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  40.21 
 
 		 495 aa  336  7e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  41.74 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  36.97 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  37.26 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  36.4 
 
 		 479 aa  272  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  35.59 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  36.4 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  36.4 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  38.33 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  38.33 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  36.32 
 
 		 477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  36.18 
 
 		 477 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  35.1 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  35.1 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  34.5 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  33.2 
 
 		 496 aa  236  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  34.11 
 
 		 540 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  35.92 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  30.43 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.03 
 
 		 482 aa  136  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  28.05 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  28.79 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.04 
 
 		 504 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  28.38 
 
 		 529 aa  125  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.8 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.17 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.23 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  25.77 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  27.84 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  28.42 
 
 		 493 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  26.63 
 
 		 496 aa  120  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  25.77 
 
 		 495 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.19 
 
 		 483 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.4 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.3 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.64 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.01 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.01 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  27.18 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  27.17 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.38 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  27.18 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 488 aa  115  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.04 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.35 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.14 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.78 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  26.59 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.02 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.22 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  28.13 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.4 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.22 
 
 		 493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.22 
 
 		 492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.28 
 
 		 492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.22 
 
 		 492 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.22 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.22 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.59 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.38 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 527 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.04 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  25 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.09 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>