177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1661 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  83.29 
 
 		 431 aa  755    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  74.7 
 
 		 424 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  71.79 
 
 		 429 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  75.99 
 
 		 429 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  74.59 
 
 		 429 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  74.36 
 
 		 429 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  70.4 
 
 		 454 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  73.66 
 
 		 429 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  75.76 
 
 		 429 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  78.49 
 
 		 429 aa  699    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  75.29 
 
 		 429 aa  690    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  75.76 
 
 		 429 aa  696    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  75.76 
 
 		 429 aa  696    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 429 aa  894    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  81.41 
 
 		 433 aa  732    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  64.15 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  55.66 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  45.63 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  46.79 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  44.44 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  43.5 
 
 		 428 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  43.82 
 
 		 412 aa  359  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  41.82 
 
 		 432 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  45.87 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  42.23 
 
 		 421 aa  346  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  40.95 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  37.47 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  41.61 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 488 aa  305  8.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  40.23 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  35.74 
 
 		 510 aa  266  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  35.27 
 
 		 460 aa  262  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  35.93 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  35.68 
 
 		 443 aa  253  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  35.15 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  31.95 
 
 		 692 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  26.69 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  30.64 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  30.64 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  27.05 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  29.48 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  24.6 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  30.23 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  27.97 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  30.23 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  30.64 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 		 538 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  28.9 
 
 		 539 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  29.89 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  30.12 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  30.83 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  29.06 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30.13 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  27.03 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  33.88 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  34.17 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  33.83 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  29.49 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  25.09 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  34.45 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  23.96 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  32.76 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  25.58 
 
 		 521 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  34.85 
 
 		 320 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  24.6 
 
 		 670 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1352  proline iminopeptidase  29.59 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  23.7 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  27.23 
 
 		 532 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  29.55 
 
 		 332 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  25 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  32.48 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  28.21 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  31.36 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  32.77 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  28.79 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  33.08 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  40.58 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  23.83 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  31.58 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  24.48 
 
 		 521 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  22.13 
 
 		 669 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  29.57 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  33.93 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  32.8 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  32.58 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  32.8 
 
 		 323 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  32.8 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>