16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1630 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1630  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97673  normal  0.0442479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2424  hypothetical protein  58.46 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3025  hypothetical protein  60.66 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256458  normal  0.331353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2597  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3087  hypothetical protein  43.08 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1531  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1409  hypothetical protein  37.14 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1474  hypothetical protein  37.14 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2675  hypothetical protein  55.81 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2166  hypothetical protein  51.11 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1462  hypothetical protein  41.27 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000246268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2759  hypothetical protein  38.89 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2777  hypothetical protein  37.04 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.627073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2458  hypothetical protein  38.89 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1599  hypothetical protein  37.74 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00429236  hitchhiker  0.000564563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2854  hypothetical protein  35.85 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>