157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1402 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  100 
 
 		 316 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  81.01 
 
 		 316 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  76.36 
 
 		 316 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  75.8 
 
 		 314 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  75.88 
 
 		 317 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  74.92 
 
 		 317 aa  494  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  72.12 
 
 		 315 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  70.68 
 
 		 312 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  67.31 
 
 		 309 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  66.35 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  65.71 
 
 		 315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  65.19 
 
 		 314 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  63.64 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  63.32 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  62.86 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  63.17 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  63.32 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  62.54 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  63.01 
 
 		 333 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  63.32 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  63.17 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  59.33 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  61.9 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  61.59 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  59.75 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  58.86 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  58.86 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  58.86 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  58.66 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  58.86 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  58.54 
 
 		 321 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  57.91 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  60.32 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  58.23 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  58.47 
 
 		 321 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  59.28 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  61.22 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  55.7 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  59.94 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  58.84 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  54.31 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  51.42 
 
 		 304 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  45.65 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  51.12 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  50.48 
 
 		 287 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  41.97 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  41.18 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  39.02 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  40.58 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  39.5 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  37.81 
 
 		 540 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  38.68 
 
 		 577 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  32.52 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  32.22 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  32.24 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  34.42 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  33.57 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  33.21 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  37.93 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  28.63 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  31.7 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  31.09 
 
 		 658 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  31.3 
 
 		 480 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  32.21 
 
 		 658 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.76 
 
 		 650 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  27.53 
 
 		 658 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  28.17 
 
 		 650 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 656 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  31.85 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  32.19 
 
 		 449 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  30.54 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  30.54 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  28.86 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  31.28 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.56 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  25.23 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.84 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  32.81 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  27.42 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  31.62 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  30.92 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  25.73 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  32.48 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  30.95 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  25.08 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  27.96 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  28.04 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.33 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.59 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.64 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.59 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.59 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.59 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  31.78 
 
 		 157 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.59 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  26.8 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>