146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1388 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  44.83 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  45.4 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  44.83 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  44.83 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  43.68 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  43.1 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  43.1 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  45.29 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  43.68 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  43.68 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  32.95 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  33.96 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  33.55 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  34.57 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  33.52 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  35.33 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  32.96 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  40.34 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  35.33 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  38.18 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  48.48 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  56.6 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  32.21 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  45.57 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  56.6 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  41.84 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  50.79 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  56.6 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  32.08 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  32.45 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  50.85 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  47.22 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  31.03 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  34.36 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  54.72 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  61.7 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  34.76 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  54.72 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  34.55 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  42.42 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  27.22 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  54.72 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  50 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  54.72 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  46.84 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  55.36 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  59.57 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  41.75 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  68.42 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  35.04 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  37.74 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  48.08 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  71.05 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  69.23 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  44.62 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  56.25 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  38.04 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  56.82 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  70.27 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  61.36 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  68.42 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  68.42 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  60.87 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  43.75 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  65.12 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  68.42 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  54.9 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  68.42 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  54.39 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  67.57 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  64.86 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  67.57 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  34 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  62.22 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  50.88 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  50.88 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  50.88 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  50.88 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  52.94 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  33.64 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  58.54 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  52.17 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  56.41 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  58.14 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  58.54 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  58.54 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  58.54 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  64.71 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  58.97 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  51.11 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  38.32 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  58.33 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  58.33 
 
 		 205 aa  47.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>