More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1328 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  73.73 
 
 		 950 aa  1461    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  50.21 
 
 		 950 aa  953    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  53.31 
 
 		 959 aa  1022    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  71.82 
 
 		 949 aa  1419    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 944 aa  1950    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  48.63 
 
 		 952 aa  911    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  73.83 
 
 		 950 aa  1461    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  74.07 
 
 		 945 aa  1508    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  73.83 
 
 		 950 aa  1463    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  76.06 
 
 		 944 aa  1482    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  73.83 
 
 		 944 aa  1463    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  65.15 
 
 		 974 aa  1299    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  47.51 
 
 		 947 aa  896    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  81.57 
 
 		 944 aa  1614    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  52.32 
 
 		 958 aa  1028    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  72.25 
 
 		 949 aa  1421    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  50.38 
 
 		 969 aa  921    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  72.03 
 
 		 949 aa  1416    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  54.76 
 
 		 945 aa  1013    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  70.88 
 
 		 943 aa  1401    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  68.78 
 
 		 945 aa  1348    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  72.25 
 
 		 949 aa  1421    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  73.31 
 
 		 944 aa  1449    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  48.47 
 
 		 947 aa  919    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  35.53 
 
 		 954 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  34.9 
 
 		 921 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  33.69 
 
 		 943 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  34.22 
 
 		 929 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  34.22 
 
 		 949 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  34.44 
 
 		 947 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  33.51 
 
 		 930 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  31.97 
 
 		 960 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  32.12 
 
 		 962 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  31.96 
 
 		 959 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  32.01 
 
 		 967 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  31.95 
 
 		 949 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 		 910 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  31.27 
 
 		 956 aa  403  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  30.96 
 
 		 952 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  32.8 
 
 		 901 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  30.65 
 
 		 903 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  32.48 
 
 		 904 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.59 
 
 		 954 aa  343  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  43.13 
 
 		 458 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  43.13 
 
 		 458 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  43.13 
 
 		 458 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.09 
 
 		 937 aa  306  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.47 
 
 		 896 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  26.51 
 
 		 929 aa  283  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.04 
 
 		 945 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  34.27 
 
 		 440 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  34.7 
 
 		 440 aa  256  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  36.47 
 
 		 470 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.48 
 
 		 918 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  34.12 
 
 		 422 aa  248  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  26.34 
 
 		 934 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 		 876 aa  244  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  35.41 
 
 		 442 aa  241  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  34.96 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  27.24 
 
 		 949 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.96 
 
 		 919 aa  229  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  33.88 
 
 		 429 aa  227  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.8 
 
 		 429 aa  221  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.3 
 
 		 452 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  26.34 
 
 		 912 aa  214  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  25.29 
 
 		 921 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.66 
 
 		 912 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  34.99 
 
 		 461 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.78 
 
 		 853 aa  207  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  36.7 
 
 		 413 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.66 
 
 		 465 aa  207  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 		 451 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  46.08 
 
 		 423 aa  207  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  32.68 
 
 		 411 aa  206  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  26.57 
 
 		 928 aa  204  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  32.62 
 
 		 427 aa  204  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  32.55 
 
 		 451 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  31.62 
 
 		 470 aa  204  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.67 
 
 		 443 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  30.99 
 
 		 450 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  31.55 
 
 		 464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  32.32 
 
 		 451 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  33.52 
 
 		 476 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  30.66 
 
 		 453 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  31.53 
 
 		 451 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.93 
 
 		 443 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  34.13 
 
 		 463 aa  201  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.93 
 
 		 443 aa  201  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  32.04 
 
 		 464 aa  200  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  30.61 
 
 		 443 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  26.92 
 
 		 957 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.93 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 840 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  34.6 
 
 		 489 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  31.59 
 
 		 453 aa  198  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  32.16 
 
 		 448 aa  198  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29.48 
 
 		 443 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.33 
 
 		 461 aa  197  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  31.44 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.62 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>