More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1299 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  66.32 
 
 		 853 aa  1134    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  66.32 
 
 		 853 aa  1134    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  47.13 
 
 		 911 aa  747    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 		 871 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  55.43 
 
 		 857 aa  961    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  66.08 
 
 		 860 aa  1134    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  48.69 
 
 		 870 aa  742    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  66.32 
 
 		 853 aa  1134    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  58.1 
 
 		 854 aa  986    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 870 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  52.24 
 
 		 882 aa  822    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 932 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  61.97 
 
 		 872 aa  1071    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  46.74 
 
 		 890 aa  705    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  57.38 
 
 		 871 aa  989    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  78.09 
 
 		 856 aa  1368    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  57.04 
 
 		 855 aa  978    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  65.81 
 
 		 851 aa  1155    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  82.61 
 
 		 859 aa  1488    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 881 aa  648    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  52.3 
 
 		 891 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  52.06 
 
 		 846 aa  854    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  51.94 
 
 		 846 aa  848    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  56.81 
 
 		 859 aa  979    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  51.84 
 
 		 891 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  50.82 
 
 		 860 aa  835    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  56.96 
 
 		 874 aa  1029    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  52.34 
 
 		 922 aa  843    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  55.41 
 
 		 868 aa  905    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  53.03 
 
 		 858 aa  862    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  53.15 
 
 		 850 aa  818    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  79.49 
 
 		 856 aa  1415    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  65.74 
 
 		 862 aa  1159    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  52.31 
 
 		 938 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  57.14 
 
 		 863 aa  976    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  56.26 
 
 		 860 aa  963    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  52.3 
 
 		 939 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 870 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  50.9 
 
 		 885 aa  804    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  49.02 
 
 		 870 aa  755    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 873 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  78.4 
 
 		 861 aa  1407    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 872 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  57.26 
 
 		 859 aa  987    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  54.55 
 
 		 871 aa  925    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  79.25 
 
 		 856 aa  1415    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  55.19 
 
 		 880 aa  954    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  50.85 
 
 		 884 aa  803    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 		 902 aa  821    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  78.9 
 
 		 856 aa  1405    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  66.04 
 
 		 851 aa  1160    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  51.84 
 
 		 893 aa  843    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  52.02 
 
 		 939 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  56.92 
 
 		 855 aa  984    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  52.3 
 
 		 939 aa  841    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  65.15 
 
 		 856 aa  1163    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  47.27 
 
 		 871 aa  729    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  52.3 
 
 		 939 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  46.19 
 
 		 882 aa  712    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  55.92 
 
 		 887 aa  981    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  54.29 
 
 		 883 aa  966    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  55.2 
 
 		 884 aa  932    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  55.2 
 
 		 884 aa  932    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  49.25 
 
 		 864 aa  787    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  50.91 
 
 		 878 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  77.56 
 
 		 862 aa  1373    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.79 
 
 		 867 aa  661    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  56.13 
 
 		 859 aa  952    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  81.8 
 
 		 855 aa  1451    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  66.32 
 
 		 853 aa  1134    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  52.79 
 
 		 916 aa  846    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  59.79 
 
 		 855 aa  1038    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 		 882 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 859 aa  1774    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 		 872 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  51.02 
 
 		 885 aa  826    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  76.57 
 
 		 854 aa  1353    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  63.8 
 
 		 889 aa  1120    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  65.62 
 
 		 851 aa  1159    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  66.04 
 
 		 851 aa  1160    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  51.02 
 
 		 885 aa  809    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  86.6 
 
 		 858 aa  1545    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  63 
 
 		 856 aa  1115    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  55.54 
 
 		 857 aa  961    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  78.4 
 
 		 861 aa  1405    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  78.28 
 
 		 861 aa  1403    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  59.88 
 
 		 878 aa  996    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  77.79 
 
 		 861 aa  1386    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 859 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 		 872 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  50.91 
 
 		 886 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  57.01 
 
 		 855 aa  982    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  79.14 
 
 		 856 aa  1412    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  65.33 
 
 		 853 aa  1143    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  66.43 
 
 		 853 aa  1149    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 870 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  51.02 
 
 		 885 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  55.96 
 
 		 857 aa  960    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  66.43 
 
 		 853 aa  1135    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.68 
 
 		 868 aa  733    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>