50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1284 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1284  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000586113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3356  hypothetical protein  84 
 
 		 201 aa  353  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1199  hypothetical protein  77.16 
 
 		 200 aa  323  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1179  hypothetical protein  75.13 
 
 		 201 aa  305  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3458  hypothetical protein  71.07 
 
 		 199 aa  298  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3147  hypothetical protein  71.57 
 
 		 199 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3292  hypothetical protein  71.57 
 
 		 199 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0753393  hitchhiker  0.0006441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1222  protein of unknown function DUF416  71.57 
 
 		 199 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.254012  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1174  hypothetical protein  71.07 
 
 		 199 aa  297  9e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.987719  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1108  hypothetical protein  71.07 
 
 		 199 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1108  hypothetical protein  71.07 
 
 		 199 aa  295  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3149  hypothetical protein  71.07 
 
 		 199 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1030  hypothetical protein  68.5 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1190  hypothetical protein  67.01 
 
 		 198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000169624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2768  hypothetical protein  71.57 
 
 		 199 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1046  hypothetical protein  64.97 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03539  putative orphan protein  41.88 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3942  hypothetical protein  38.54 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00422867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0289  hypothetical protein  38.83 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0272333  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4500  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.0975935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4502  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4413  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4576  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.549774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4490  hypothetical protein  37.77 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4447  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  hitchhiker  0.000696579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4026  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0175566 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3995  protein of unknown function DUF416  38.3 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03829  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4233  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4542  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03876  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4380  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0212  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0171046  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3865  protein of unknown function DUF416  37.77 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.946564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5468  hypothetical protein  37.77 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0221  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0225  protein of unknown function DUF416  37.23 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.254362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0461  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.534971  hitchhiker  0.00251619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0353  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3847  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.397405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002180  hypothetical protein  34.74 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.105227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3711  protein of unknown function DUF416  36.7 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.610498  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00215  hypothetical protein  33.68 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0515  hypothetical protein  31.96 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2848  hypothetical protein  32.28 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.044435  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2646  hypothetical protein  32.28 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0153  hypothetical protein  31.53 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1539  hypothetical protein  32.49 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000333486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3217  hypothetical protein  29.84 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0942  hypothetical protein  27.18 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>