217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1189 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  72.9 
 
 		 468 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  67.09 
 
 		 481 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  72.79 
 
 		 468 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  72.26 
 
 		 468 aa  670    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  73.82 
 
 		 468 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  72.9 
 
 		 468 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  70.32 
 
 		 481 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  100 
 
 		 477 aa  974    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  73.39 
 
 		 468 aa  695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  75.7 
 
 		 466 aa  740    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  72.35 
 
 		 468 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  74.95 
 
 		 468 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  70.79 
 
 		 469 aa  683    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  69.63 
 
 		 467 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  73.59 
 
 		 414 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  56.33 
 
 		 472 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  49.65 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  48.61 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  47.84 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  47.36 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  46.79 
 
 		 471 aa  345  8e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  38.49 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  41.45 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  38 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  34.56 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  35.21 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  36.7 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  35.75 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.88 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  35.22 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.61 
 
 		 525 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  22.28 
 
 		 552 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.46 
 
 		 544 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  24.14 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  29.29 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.51 
 
 		 578 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  23.4 
 
 		 526 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.55 
 
 		 497 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.77 
 
 		 487 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  26.04 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.94 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  24.03 
 
 		 698 aa  80.1  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.11 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  24.6 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  23.12 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  23.87 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  24.76 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.37 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  24.84 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.2 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  35.51 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.99 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.84 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  23.99 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.99 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.99 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  24.71 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  40 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  24.71 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  34.38 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  30.92 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  31.58 
 
 		 734 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  24.78 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  29.28 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  25.27 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  24.2 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  28.62 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  37.21 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.79 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  38.89 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  29.61 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  28.7 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  29.78 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  27.4 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  28.02 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.95 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  27.97 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  23.21 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  46.74 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  33.87 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  27.25 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  33.33 
 
 		 678 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  41.3 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  34.29 
 
 		 743 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  27.98 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  35.85 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  39.8 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  33.33 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  26.79 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  35.96 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  27.56 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  28 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  39.8 
 
 		 536 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  27.56 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  24.22 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  29.79 
 
 		 947 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  38.89 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  38.71 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>