80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1130 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  88.98 
 
 		 355 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  92.35 
 
 		 355 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  88.98 
 
 		 355 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  90.99 
 
 		 357 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 357 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  88.98 
 
 		 355 aa  641    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  88.42 
 
 		 355 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  88.98 
 
 		 355 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  90.75 
 
 		 339 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  88.24 
 
 		 358 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  89.82 
 
 		 335 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  89.52 
 
 		 335 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  89.52 
 
 		 335 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  89.52 
 
 		 335 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  81.55 
 
 		 340 aa  548  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  68.77 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  28.52 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.81 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  33.79 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.79 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 		 348 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 		 361 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  33.5 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.32 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.87 
 
 		 618 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  22.28 
 
 		 513 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  22.78 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  25.25 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  25.25 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  25.25 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.33 
 
 		 753 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  22.95 
 
 		 725 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  23.83 
 
 		 469 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  24.02 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  23.36 
 
 		 694 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  20.94 
 
 		 645 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  22.87 
 
 		 645 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  20.3 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 		 681 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  21.98 
 
 		 701 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.65 
 
 		 656 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.92 
 
 		 657 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  21.53 
 
 		 651 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.68 
 
 		 764 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  22.53 
 
 		 701 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  21.79 
 
 		 756 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  24.75 
 
 		 1156 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  23.19 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  23.32 
 
 		 1134 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  22.92 
 
 		 1037 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  18.72 
 
 		 746 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  20.86 
 
 		 752 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  23.7 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  25.37 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  21.7 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.33 
 
 		 723 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  23.65 
 
 		 1020 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  23.39 
 
 		 607 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  20.11 
 
 		 699 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  22.92 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  19.78 
 
 		 723 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.43 
 
 		 703 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  23.96 
 
 		 667 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  23.46 
 
 		 729 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 		 1093 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  22.29 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>