More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1089 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1089  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 		 339 aa  707    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1301  aspartate carbamoyltransferase  88.76 
 
 		 339 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1238  aspartate carbamoyltransferase  88.17 
 
 		 339 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324325  normal  0.849044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  94.1 
 
 		 339 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.00000909543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1013  aspartate carbamoyltransferase  91.45 
 
 		 339 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2892  aspartate carbamoyltransferase  89.05 
 
 		 339 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000646707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2974  aspartate carbamoyltransferase  89.05 
 
 		 339 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.771766  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3070  aspartate carbamoyltransferase  89.05 
 
 		 339 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  89.97 
 
 		 339 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1120  aspartate carbamoyltransferase  88.46 
 
 		 339 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  89.35 
 
 		 339 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1205  aspartate carbamoyltransferase  88.17 
 
 		 339 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3152  aspartate carbamoyltransferase  88.17 
 
 		 339 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1160  aspartate carbamoyltransferase  88.17 
 
 		 339 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2979  aspartate carbamoyltransferase  86.69 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2818  aspartate carbamoyltransferase  84.32 
 
 		 339 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0185554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  75.07 
 
 		 354 aa  535  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  72.89 
 
 		 334 aa  521  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4628  aspartate carbamoyltransferase  64.88 
 
 		 337 aa  464  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  65.86 
 
 		 337 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4709  aspartate carbamoyltransferase  53.03 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4187  aspartate carbamoyltransferase  53.03 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3798  aspartate carbamoyltransferase  53.03 
 
 		 431 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5476  aspartate carbamoyltransferase  52.42 
 
 		 431 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3560  aspartate carbamoyltransferase  52.42 
 
 		 431 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4807  aspartate carbamoyltransferase  52.42 
 
 		 431 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  52.42 
 
 		 431 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0897  aspartate carbamoyltransferase  52.73 
 
 		 431 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4730  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 		 430 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  0.148121 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5513  aspartate carbamoyltransferase  50.15 
 
 		 431 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1687  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 		 431 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0197  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1605  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2108  aspartate carbamoyltransferase  52.73 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0801752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5900  aspartate carbamoyltransferase  52.42 
 
 		 430 aa  351  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0063  aspartate carbamoyltransferase  51.06 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.631606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  44.62 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.04 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.07 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.07 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.04 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.95 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.39 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06000  aspartate carbamoyltransferase, putative  40.94 
 
 		 2333 aa  238  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00636164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.89 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.8 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90563  multifunctional pyrimidine biosynthesis protein (PYR1)  42.14 
 
 		 2211 aa  235  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0682407 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.7 
 
 		 314 aa  233  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  37.66 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  39.49 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  0.000000216134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.63 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  39.74 
 
 		 359 aa  225  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.17 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00565  Protein pyrABCN [Includes Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate(EC 6.3.5.5);Aspartate carbamoyltransferase(EC 2.1.3.2)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O93937]  40.3 
 
 		 2275 aa  225  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.1 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.25 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.25 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.31 
 
 		 298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.25 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.25 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.82 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.82 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.49 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.94 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.2 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.64 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0780  aspartate carbamoyltransferase  42.22 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1686  aspartate carbamoyltransferase  39.81 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.467419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.32 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.38 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.38 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.9 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0534  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.11 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.726764  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0927  aspartate carbamoyltransferase  38.92 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.06 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.26 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.56 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2536  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.5 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.29 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0258  aspartate carbamoyltransferase  38.46 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_19816  aspartate carbamoyltransferase  38.78 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.904682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0357  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.41 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.127039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.22 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.99 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1664  aspartate carbamoyltransferase  37.99 
 
 		 317 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.31 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3465  aspartate carbamoyltransferase  37.38 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36.27 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>