More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1066 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  68.56 
 
 		 706 aa  981    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.41 
 
 		 706 aa  990    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  65.82 
 
 		 705 aa  930    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 705 aa  1431    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.55 
 
 		 706 aa  969    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.12 
 
 		 706 aa  986    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.41 
 
 		 706 aa  990    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.98 
 
 		 706 aa  984    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.6 
 
 		 706 aa  895    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.18 
 
 		 705 aa  908    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.07 
 
 		 705 aa  988    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.41 
 
 		 706 aa  990    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.97 
 
 		 706 aa  1003    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  40.76 
 
 		 743 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 		 707 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  37.09 
 
 		 704 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  35.47 
 
 		 712 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.21 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.3 
 
 		 716 aa  333  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 688 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.88 
 
 		 695 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.31 
 
 		 688 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 688 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 688 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.17 
 
 		 713 aa  317  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  31.07 
 
 		 714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  32.03 
 
 		 714 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.9 
 
 		 714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  30.08 
 
 		 715 aa  297  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 712 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 		 738 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.14 
 
 		 714 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.83 
 
 		 714 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 		 714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.91 
 
 		 716 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  32.97 
 
 		 697 aa  250  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.67 
 
 		 741 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  32.64 
 
 		 698 aa  243  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.39 
 
 		 731 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  29.82 
 
 		 701 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.08 
 
 		 699 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  26.11 
 
 		 713 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.78 
 
 		 740 aa  231  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  28.71 
 
 		 720 aa  229  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 		 631 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  31.71 
 
 		 682 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 		 637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.98 
 
 		 730 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 		 645 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 637 aa  217  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 630 aa  216  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  27.76 
 
 		 778 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  28.26 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 627 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 626 aa  215  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 543 aa  213  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 645 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.53 
 
 		 779 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  30.23 
 
 		 639 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  29.98 
 
 		 627 aa  211  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 		 543 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 		 543 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  30.39 
 
 		 627 aa  211  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  37.66 
 
 		 638 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 543 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 636 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 543 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 		 730 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.65 
 
 		 548 aa  207  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 		 543 aa  207  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 		 622 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  29.82 
 
 		 623 aa  207  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  36.2 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  29.98 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  39.32 
 
 		 628 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.63 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.55 
 
 		 645 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  31.57 
 
 		 643 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 638 aa  204  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 		 541 aa  203  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.65 
 
 		 632 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.39 
 
 		 720 aa  203  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  36 
 
 		 639 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 645 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  29.89 
 
 		 633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.55 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.39 
 
 		 648 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 623 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 		 554 aa  201  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 		 638 aa  200  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 666 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 623 aa  200  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  33.51 
 
 		 578 aa  200  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.72 
 
 		 626 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>