97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0983 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 294 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  66.78 
 
 		 292 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  58.31 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  60.44 
 
 		 311 aa  355  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  54.91 
 
 		 288 aa  334  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  52.58 
 
 		 287 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  53.87 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  52.23 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  52.23 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  49.66 
 
 		 304 aa  328  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  50 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  50 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  53.51 
 
 		 268 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  54.95 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  29.9 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  29.48 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  29.48 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  27.08 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  27.12 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  26.88 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  27.04 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  26.94 
 
 		 248 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  26.94 
 
 		 248 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  26.94 
 
 		 248 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  27.61 
 
 		 248 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  28.02 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  27.63 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  27.73 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  27.73 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  27.24 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  27.24 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  28.02 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  27.24 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  27.24 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  27.24 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  23.72 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  27.1 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  27.1 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  25.08 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  27.1 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  25.08 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  29.49 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  29.49 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  30.32 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  28.24 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  28.47 
 
 		 497 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  29.37 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  28.21 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  24.12 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  23.74 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  26.28 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  25.33 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  22.62 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  29.85 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  22.34 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  27.7 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  21.72 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  26 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  20 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  22.58 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  24.66 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  23.81 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  22.62 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  25.19 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  23.57 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 250 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  19.45 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  23.33 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  24.29 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  21.92 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  21.92 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  22.6 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  24.8 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  22.45 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1157  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  21.92 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  21.92 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  24.15 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  23.76 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  22.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  30.68 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3064  MltA-interacting MipA family protein  24.32 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  26.97 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2040  MltA-interacting MipA family protein  26.43 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  22.52 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>