57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0978 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  58.99 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  58.99 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  58.43 
 
 		 178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  56.74 
 
 		 178 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  64.25 
 
 		 179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  56.5 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  57.63 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  56.5 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  63.12 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  57.63 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  50.62 
 
 		 175 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  57.23 
 
 		 179 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0875  hypothetical protein  60.87 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000548389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  53.99 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  27.17 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3296  hypothetical protein  55.56 
 
 		 55 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.766582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0993  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  27.98 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  27.68 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  30.27 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  26.23 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  25.3 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  27.81 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  27.46 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  27.23 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  26.37 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  28.02 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  25.14 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  25.89 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  27.08 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  25.56 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  25.42 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  26.09 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  28 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  24.06 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  28.92 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  25.41 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  26.9 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  24.71 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  26.19 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  25.29 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  25.13 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  21.59 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  26.06 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  25.29 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>