89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0958 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  94.84 
 
 		 156 aa  289  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  89.03 
 
 		 156 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  90.32 
 
 		 155 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  88.39 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  88.39 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  88.39 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  88.39 
 
 		 157 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  88.39 
 
 		 157 aa  276  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  89.03 
 
 		 157 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  87.74 
 
 		 157 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  80.65 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  81.29 
 
 		 157 aa  257  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  77.42 
 
 		 155 aa  246  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  54.55 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  53.25 
 
 		 157 aa  173  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  53.55 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  53.9 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  51.95 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  49.68 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  50.33 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  49.02 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  47.1 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  47.1 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  47.1 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  47.1 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  47.1 
 
 		 157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  46.41 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  46.71 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  46.71 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  46.45 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  48.37 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  47.06 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  46.41 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  47.71 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  46.41 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  44 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  35.95 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  31.79 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  33.77 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  41.51 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  35.33 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  29.58 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  28.87 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  36.59 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  30.57 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  34 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  30.41 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  30.41 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  29.17 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  33.58 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  34 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  26.45 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  36.36 
 
 		 478 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  31.85 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  25.74 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  29.37 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  28.46 
 
 		 440 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  27.94 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  29.1 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  28.76 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  25.19 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  25.19 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  26.92 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  26.74 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  32.58 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  27.81 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  27.15 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  26.53 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  35.11 
 
 		 464 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  25.66 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  30.25 
 
 		 461 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  24.77 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  24.77 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  25.53 
 
 		 637 aa  40.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  31.93 
 
 		 467 aa  40.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>