144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0849 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  78.83 
 
 		 390 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  78.72 
 
 		 390 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  78.06 
 
 		 390 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  83.93 
 
 		 395 aa  689    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  79.34 
 
 		 390 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  840    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  77.81 
 
 		 390 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  89.82 
 
 		 393 aa  732    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  78.06 
 
 		 390 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  78.46 
 
 		 390 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  78.46 
 
 		 390 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  64.01 
 
 		 386 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  65.04 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  60.36 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  59.23 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  58.97 
 
 		 387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  58.46 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  57.36 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  56.64 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  57.14 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  57.91 
 
 		 386 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  56.89 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  53.92 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  57.61 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  57.61 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  54.68 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  57.61 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  57.61 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  57.87 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  57.61 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  57.61 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  55.36 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  56.89 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  58.16 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  57.65 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  57.65 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  54.66 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  57.4 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  57.65 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  56.89 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  51.75 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  53.32 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  52.04 
 
 		 385 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  49.75 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  52.15 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  48.88 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  48.88 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  48.88 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  46.98 
 
 		 388 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  46.6 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  46.27 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  41.62 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  41.09 
 
 		 362 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  40.58 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  40.73 
 
 		 361 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  36.48 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  35.71 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.72 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  38.44 
 
 		 385 aa  200  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  33.61 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.4 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.8 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.97 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.97 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.65 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.95 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  28.73 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.94 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.68 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.06 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.56 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.27 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.79 
 
 		 363 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.97 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  27.46 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.3 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.45 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.35 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  27.02 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.19 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  24.15 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  21.61 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  21.82 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.18 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.18 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.29 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.12 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  23.67 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  21.79 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  59.65 
 
 		 84 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  24.1 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  21.73 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  21.73 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.96 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  26.3 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  22.81 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.04 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  25.06 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>