More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0798 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  83.45 
 
 		 435 aa  728    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 432 aa  878    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  89.81 
 
 		 432 aa  779    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  84.38 
 
 		 435 aa  730    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  82.52 
 
 		 435 aa  743    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  83.92 
 
 		 435 aa  730    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  84.15 
 
 		 435 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  87.73 
 
 		 432 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  83.68 
 
 		 435 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  83.68 
 
 		 435 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  82.64 
 
 		 435 aa  749    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  84.38 
 
 		 435 aa  730    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  83.68 
 
 		 435 aa  729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  85.95 
 
 		 431 aa  766    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  83.64 
 
 		 435 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  84.15 
 
 		 435 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  67.6 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  65.35 
 
 		 432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  63.62 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  64.72 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  64.49 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  64.64 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  64.02 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  62.15 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  63.47 
 
 		 426 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  62.7 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  62.7 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  62.44 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  63.15 
 
 		 426 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  62.76 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  62.47 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  62.09 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  62.91 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  63.15 
 
 		 426 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  62.44 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  63.15 
 
 		 426 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  63.15 
 
 		 426 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  63.79 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  62.53 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  61.36 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  60.53 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  59.53 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  59.07 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  59.3 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  59.3 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  59.3 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  59.3 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  59.04 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  59.28 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  58.37 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  57.38 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  57.76 
 
 		 481 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  57.14 
 
 		 489 aa  478  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  58.89 
 
 		 454 aa  471  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  60.05 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  58.89 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  57 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  59.07 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  59.07 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  59.07 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  55.01 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0524  GTP-binding protein, HSR1-like  58.66 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227372  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  57.91 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  56.58 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  56.14 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  56.14 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0580  GTP-binding protein hflX  54.08 
 
 		 427 aa  448  1.0000000000000001e-124  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  53.01 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  55.24 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  59.83 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  51.64 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  55.58 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  57.7 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  59.6 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  59.03 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  59.6 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  59.31 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  52.33 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  59.03 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  59.6 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  59.6 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  59.03 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  59.6 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  59.03 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  59.03 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  59.03 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  58.74 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  57.65 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  59.03 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  59.03 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  58.74 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  57.22 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  54.45 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>