19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0764 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  931    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4205  hypothetical protein  69.27 
 
 		 440 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000231794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  59.6 
 
 		 420 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3276  hypothetical protein  56.73 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0384  hypothetical protein  44.53 
 
 		 406 aa  316  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00015  hypothetical protein  43.22 
 
 		 336 aa  285  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  25.81 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  25.22 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  24.49 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  30.09 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  30.97 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  27.43 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  27.43 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  25.76 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  27.43 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  24.4 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  28.97 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  23.15 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1425  surface antigen (D15)  29.17 
 
 		 843 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491464  normal  0.10805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>