More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0700 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0283  ABC transporter related  53.49 
 
 		 260 aa  221  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0784  ABC transporter related  50.45 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0829  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  46.96 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 272 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0223  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00787996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 253 aa  191  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  45.37 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 287 aa  188  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  46.23 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1826  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.61 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 252 aa  187  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  45.37 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  46.95 
 
 		 262 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0592  ABC transporter related  46.12 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3953  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 		 279 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179007  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  45.07 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2121  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.89 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1887  phosphate ABC transporter permease  44.66 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0483  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00884783  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 284 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  43.75 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0183  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000942393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 284 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000353293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  44.05 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  42.41 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  43.81 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  41.05 
 
 		 259 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  43.06 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  45.79 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  42.25 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0702  ABC transporter related  45.33 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 		 260 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0444  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1879  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 276 aa  179  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.415603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1050  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  43.52 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  hitchhiker  0.000000448659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2485  ABC transporter related  44.87 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08631  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.296362  hitchhiker  0.00137214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 276 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  41.28 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>