More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0697 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  59.41 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  49.45 
 
 		 277 aa  271  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  59.04 
 
 		 281 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  54.28 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  56.56 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  47.1 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  44.4 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  43.98 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  42.91 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  44.08 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  40.42 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  40.25 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  38.13 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  38.68 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  40.3 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  38.46 
 
 		 381 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  32.75 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  39.55 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  44.31 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  36.48 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.04 
 
 		 278 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  43.27 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  37.74 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  38.08 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  37.08 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  35.16 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  33.21 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  34.69 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  33.6 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  35.09 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  38.46 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  35.34 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  35.8 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  34.54 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  33.45 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  37.25 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  37.17 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.52 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  34.01 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  37.79 
 
 		 272 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  34.84 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  36.36 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.57 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  36.14 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.13 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.38 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  34.38 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.38 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.38 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.38 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  34.38 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.85 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.38 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  33.6 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  35.98 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.52 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  36.57 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.99 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  34.15 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 304 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.19 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  32.59 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  36.41 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  38.81 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.87 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.66 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  33.46 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  34.16 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  32.93 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  36.36 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  35.35 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.73 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  31.33 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  34.15 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  31.33 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  31.45 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  33.64 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  32.67 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.93 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  35.92 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  35.71 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  30.35 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  31.52 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  33.57 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  34.29 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.59 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  30.68 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.36 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  34.25 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  29.89 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1881  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.7 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  36.22 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  33.22 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  30.77 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  32.92 
 
 		 330 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1882  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.07 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.628761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>