103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0655 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 526 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  25.56 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  24.11 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  24.3 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.57 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  22.73 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  23.81 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  25.74 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 299 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.37 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  22.93 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  27.37 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  26.22 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  26.84 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  24.33 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  36.36 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  25.37 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  25.25 
 
 		 444 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  22.26 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  22.94 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  21.46 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  24.19 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.97 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  22.58 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  23.18 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3951  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.23 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00829584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1550  Beta-lactamase-like  26.21 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  23.1 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.25 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  31.58 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  23.4 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  22.83 
 
 		 333 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1269  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.914297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4179  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0232  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3973  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1239  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.668505  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1373  Beta-lactamase-like  24.27 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3534  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 208 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.66 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  21.36 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4002  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3405  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0745  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2615  metallo-beta-lactamase family protein  32.93 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1236  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  21.46 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  21.35 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2932  metallo-beta-lactamase family protein  32.93 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0441  beta-lactamase superfamily hydrolase  36.67 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1114  beta-lactamase superfamily hydrolase  38.33 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0023  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2530  metallo-beta-lactamase family protein YycJ  35.38 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.22966  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  21.46 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0022  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0022  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2814  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2799  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00920301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.1 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1631  metallo-beta-lactamase family protein  31.08 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0446531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.97 
 
 		 555 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0631  beta-lactamase domain protein  35.8 
 
 		 265 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1944  Beta-lactamase-like  31.65 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2896  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>