More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0639 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  72.48 
 
 		 218 aa  322  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  55.96 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  59.45 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  59.07 
 
 		 217 aa  264  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  55.96 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  57.21 
 
 		 216 aa  260  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  55.05 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  54.88 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  48.17 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.84 
 
 		 261 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  28.86 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  30.61 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  27.6 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  28.5 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.27 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  28.34 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 870 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  29.02 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  26.84 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  28.76 
 
 		 872 aa  69.7  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 401 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  27.45 
 
 		 456 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 401 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  24.3 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 		 576 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.89 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.09 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.88 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  26.87 
 
 		 517 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  27.44 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  25.78 
 
 		 872 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  26.13 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.39 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  28.43 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.03 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  24.47 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  25.11 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  27.1 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  26.59 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  27.38 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 		 448 aa  62  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 312 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  31.33 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  26.89 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  26.34 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  26.26 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  26.02 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  26.02 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.43 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  23.85 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  24.22 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 		 844 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  26.76 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  26.87 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  26.92 
 
 		 776 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.5 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  26.24 
 
 		 493 aa  58.9  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  28.17 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.43 
 
 		 355 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  23.6 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.93 
 
 		 710 aa  58.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  26.23 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  30.37 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  29.14 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  25.23 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  29.68 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  24.72 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  27.47 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1033 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>