More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0552 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  54.49 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  54.91 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  51.15 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  46.11 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  50 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  47.98 
 
 		 172 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  50 
 
 		 176 aa  133  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  50 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  50 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  50 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  45.65 
 
 		 186 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  49.41 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  44.25 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  51.55 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  45.09 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  44.13 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  47.4 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  50 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  50.63 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  43.45 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  49.03 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  55.88 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  53.85 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  43.14 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  63.41 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  52.94 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  57.73 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  40.11 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  61.96 
 
 		 169 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  52.8 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  44.3 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  40.12 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.44 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  41.06 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  48.91 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 179 aa  90.5  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  36.26 
 
 		 187 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  57.35 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  57.33 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  38.99 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  54.67 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  54.67 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  54.67 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  57.14 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  54.67 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  51.43 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  62.12 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  36.81 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  60.61 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  45.45 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  50.67 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  60.61 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  32.32 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  60.61 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  39.02 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  34.81 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  66.07 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  35.03 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  56.34 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  56.34 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  56.34 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  58.06 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  60.34 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  63.16 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  60.34 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  33.93 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  56.45 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  59.65 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  54.69 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  54.69 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  54.69 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  55.38 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  58.33 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  53.85 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  58.73 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  49.25 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  52.17 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  54.84 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  42 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  53.85 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  49.28 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  38.54 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  38.54 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  38.54 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  38.54 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  52.31 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  52.31 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  38.89 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  50.7 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  60.38 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  38.89 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  38.1 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  38.89 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000280  MSHA pilin protein MshA  36.46 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.528287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  50.79 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  48.28 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>