91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0447 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1265    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  56.05 
 
 		 687 aa  737    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  58.96 
 
 		 642 aa  752    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  50.45 
 
 		 655 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  43.13 
 
 		 657 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  44.5 
 
 		 680 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  43.07 
 
 		 677 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  37.76 
 
 		 700 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  38.12 
 
 		 696 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  37.83 
 
 		 696 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  37.71 
 
 		 701 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  37.71 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  37.71 
 
 		 701 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  37.71 
 
 		 698 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.2  hypothetical protein  34.65 
 
 		 310 aa  170  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.3  hypothetical protein  53.03 
 
 		 122 aa  91.3  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  24.49 
 
 		 639 aa  90.1  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  23.6 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  33.5 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.58 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  33.33 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.21 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  32.5 
 
 		 646 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  29.06 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  31 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  28.22 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  29.06 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  31 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  21.83 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.94 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.9 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  32.39 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  33.87 
 
 		 843 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  29.77 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.44 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  28.97 
 
 		 766 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  22.48 
 
 		 650 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  22.66 
 
 		 650 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  31.28 
 
 		 822 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  26.77 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  31.82 
 
 		 765 aa  57.4  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  21.56 
 
 		 650 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  22.08 
 
 		 650 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  27.88 
 
 		 764 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.14 
 
 		 770 aa  54.7  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  34.09 
 
 		 778 aa  54.3  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  22.25 
 
 		 725 aa  53.9  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  21.71 
 
 		 650 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  32.82 
 
 		 762 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  21.71 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  34.38 
 
 		 764 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  28.26 
 
 		 788 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  31 
 
 		 758 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  32.47 
 
 		 762 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  34.38 
 
 		 761 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  37.89 
 
 		 762 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  23.33 
 
 		 729 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  34.38 
 
 		 764 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  34.38 
 
 		 761 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  22.22 
 
 		 719 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  28.26 
 
 		 789 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  28.34 
 
 		 788 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  21.14 
 
 		 724 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  29.61 
 
 		 754 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  22.06 
 
 		 722 aa  50.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  37.88 
 
 		 945 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  28.26 
 
 		 789 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.18 
 
 		 826 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  29.73 
 
 		 755 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  21.97 
 
 		 656 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 730 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 730 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 730 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  21.38 
 
 		 720 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  22.6 
 
 		 727 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  21.36 
 
 		 731 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  31.25 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  22.82 
 
 		 764 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  21.34 
 
 		 735 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  36.62 
 
 		 738 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  28.43 
 
 		 724 aa  45.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.6 
 
 		 936 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  26.56 
 
 		 660 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.32 
 
 		 731 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.1  hypothetical protein  48.08 
 
 		 135 aa  44.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  52.63 
 
 		 545 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  22.37 
 
 		 816 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  36.49 
 
 		 745 aa  43.9  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  37.5 
 
 		 757 aa  43.9  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.35 
 
 		 820 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.47 
 
 		 731 aa  43.5  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>