141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0436 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1170  metalloendopeptidase PepO  46.37 
 
 
687 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0429  M13 family peptidase  77.66 
 
 
680 aa  1111    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3844  M13 family peptidase  48.7 
 
 
694 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00685  metalloendopeptidase PepO  45.76 
 
 
688 aa  639    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1089  endothelin-converting protein 1  46.91 
 
 
695 aa  685    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000391271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3353  endothelin-converting protein 1  52.74 
 
 
693 aa  755    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000120839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0433  endothelin-converting protein 1  76.93 
 
 
680 aa  1107    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000749022  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3179  endothelin-converting protein 1  48.92 
 
 
694 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00771083  normal  0.176468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0787  endothelin-converting protein 1  49.06 
 
 
694 aa  690    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.945609  normal  0.609881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3594  endothelin-converting protein 1  76.79 
 
 
680 aa  1104    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00014844  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0842  endothelin-converting protein 1  46.47 
 
 
695 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000483693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3851  Endothelin-converting enzyme 1  77.08 
 
 
680 aa  1125    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000731765  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3557  Endothelin-converting enzyme 1  47.77 
 
 
694 aa  688    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000106684  normal  0.0284487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0431  peptidase M13  76.79 
 
 
680 aa  1101    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000285059  normal  0.587511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0759  peptidase M13  48.92 
 
 
694 aa  692    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000318584  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0380  endothelin-converting protein 1  72.78 
 
 
686 aa  1059    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000833432  normal  0.388237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2615  endothelin-converting protein 1  47.63 
 
 
695 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602368  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0685  endothelin-converting protein 1  47.98 
 
 
694 aa  688    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3908  endothelin-converting protein 1  77.08 
 
 
680 aa  1123    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000304576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2973  endothelin-converting protein 1  47.26 
 
 
694 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0149701  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3426  endothelin-converting protein 1  80.56 
 
 
684 aa  1178    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000894616  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0791  endothelin-converting protein 1  48.27 
 
 
694 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3412  endothelin-converting protein 1  77.23 
 
 
680 aa  1120    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3687  Neprilysin  46.2 
 
 
681 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.961749  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3625  endothelin-converting protein 1  49.54 
 
 
654 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3928  endothelin-converting protein 1  77.23 
 
 
680 aa  1125    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0436  endothelin-converting protein 1  100 
 
 
684 aa  1421    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000525642  decreased coverage  0.00000000576853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3509  endothelin-converting protein 1  46.91 
 
 
694 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000108366  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3177  endothelin-converting protein 1  46.04 
 
 
694 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000449633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3748  endothelin-converting protein 1  47.98 
 
 
694 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000230023  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4049  endothelin-converting protein 1  77.23 
 
 
680 aa  1124    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000180247  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0324  endothelin-converting protein 1  84.94 
 
 
684 aa  1236    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000623227  decreased coverage  0.00121593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0911  endothelin-converting protein 1  47.41 
 
 
694 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000483168  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4429  Endothelin-converting enzyme 1  48.07 
 
 
659 aa  633  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437954  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1104  Neprilysin  47.15 
 
 
671 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0419404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4490  Neprilysin  46.7 
 
 
670 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1374  Neprilysin  46.97 
 
 
662 aa  608  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.367096  hitchhiker  0.00589485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0157  PgPepO oligopeptidase  47.45 
 
 
672 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0166  PgPepO oligopeptidase  47.51 
 
 
664 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0514  endothelin-converting protein 1  46.37 
 
 
681 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296446  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4678  endothelin-converting protein 1  45.75 
 
 
722 aa  606  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0147  PgPepO oligopeptidase  47.21 
 
 
664 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0472  neprilysin  45.73 
 
 
666 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0927032  normal  0.0519696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0163  endothelin-converting protein 1  44.05 
 
 
687 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24530  endothelin-converting enzyme  44.01 
 
 
673 aa  594  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0503062  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0184  neprilysin  45.71 
 
 
673 aa  592  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10200  zinc metalloprotease  45.52 
 
 
663 aa  588  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0474  endothelin-converting protein 1  43.27 
 
 
692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00398267  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1964  Endothelin-converting enzyme 1  45.55 
 
 
650 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0473  endothelin-converting protein 1  43.3 
 
 
695 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.190105  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0946  Endothelin-converting enzyme 1  44.11 
 
 
665 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1728  endothelin-converting protein 1  45.29 
 
 
686 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1239  Endothelin-converting enzyme 1  42.79 
 
 
678 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2227  endothelin-converting protein 1  44.31 
 
 
680 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0489343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3633  endothelin-converting protein 1  41.53 
 
 
689 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000899606  decreased coverage  0.0000004601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1725  endothelin-converting protein 1  43.4 
 
 
682 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1958  endothelin-converting protein 1  41.89 
 
 
689 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000435105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3364  endothelin-converting protein 1  43.1 
 
 
651 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3239  endothelin-converting protein 1  42.1 
 
 
692 aa  555  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0116  Neprilysin  43.99 
 
 
651 aa  555  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0346  Neprilysin  43.9 
 
 
676 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0131  endothelin-converting protein 1  42.77 
 
 
649 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3909  endothelin-converting protein 1  41.67 
 
 
690 aa  548  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000503198  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0428  Endothelin-converting enzyme 1  39.83 
 
 
703 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386661  normal  0.0478965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3401  Endothelin-converting enzyme 1  40.9 
 
 
709 aa  545  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1065  Endothelin-converting enzyme 1  41.63 
 
 
679 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02849  putative peptidase M13 family protein  40.95 
 
 
695 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.535819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1440  neutral zinc metallopeptidase M13 family protein  40.32 
 
 
687 aa  534  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0159  endopeptidase PepO  40.87 
 
 
689 aa  532  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0959  endothelin-converting protein 1  42.03 
 
 
698 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1810  neprilysin  42.64 
 
 
683 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0811  Endothelin-converting enzyme 1  41.67 
 
 
658 aa  519  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.446841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2621  Neprilysin  41.73 
 
 
661 aa  522  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.792249  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3809  Endothelin-converting enzyme 1  38.8 
 
 
704 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.722152  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1078  PgPepO oligopeptidase  40.18 
 
 
683 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00182798  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3866  endothelin-converting protein 1  38.52 
 
 
704 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4614  endothelin-converting protein 1  42 
 
 
668 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04757  metallopeptidase  40.32 
 
 
685 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.515497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0491  M13 family peptidase  37.57 
 
 
711 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3991  endothelin-converting protein 1  38.52 
 
 
704 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.720524  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0499  endothelin-converting protein 1  37.48 
 
 
710 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3531  endothelin-converting protein 1  38.47 
 
 
710 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0450  endothelin-converting protein 1  38.23 
 
 
704 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3441  endothelin-converting protein 1  39.91 
 
 
667 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03039  metallopeptidase  37.89 
 
 
701 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4486  Endothelin-converting enzyme 1  41.47 
 
 
673 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000750073  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2834  PgPepO oligopeptidase  37.86 
 
 
694 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0726503  normal  0.179326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11790  endothelin-converting enzyme  41.83 
 
 
676 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.770299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0500  peptidase M13  39.73 
 
 
710 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1199  Endothelin-converting enzyme 1  38.74 
 
 
697 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.108357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0167  Endothelin-converting enzyme 1  39.68 
 
 
692 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21550  endothelin-converting enzyme  41.15 
 
 
662 aa  503  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00980776  hitchhiker  0.000469406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2874  Endothelin-converting enzyme 1  40.14 
 
 
734 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.845609  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4515  PgPepO oligopeptidase  38.91 
 
 
685 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857143  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1845  Endothelin-converting enzyme 1  39.74 
 
 
688 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.685788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4331  Endothelin-converting enzyme 1  39.46 
 
 
679 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1996  Endothelin-converting enzyme 1  39.19 
 
 
687 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.451521  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1908  neutral endopeptidase  38.85 
 
 
724 aa  497  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1141  PgPepO oligopeptidase  39.02 
 
 
686 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2006  endothelin-converting protein 1  38.14 
 
 
678 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>