59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0367 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 450 aa  920    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  69.11 
 
 		 448 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  31.97 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  30.12 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  28.85 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  28.83 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  31.5 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  27.2 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  25.55 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  27.79 
 
 		 364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  30.15 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  31.53 
 
 		 291 aa  113  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  28.44 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  28.21 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  30.45 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  29.15 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  29.37 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  26.4 
 
 		 575 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  27.89 
 
 		 446 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  28.18 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  28.13 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  28.09 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  26.9 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  27.71 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  28.41 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  28.34 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  29.23 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  26.59 
 
 		 437 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  25.9 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  25.9 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  25.9 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  25.9 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  27.46 
 
 		 450 aa  90.1  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  28.06 
 
 		 389 aa  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  27.46 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  26.1 
 
 		 526 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  28.21 
 
 		 389 aa  87  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  26.07 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  29.61 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  25.88 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  25.81 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  25.58 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  25.76 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  27.22 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  24.54 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  25.94 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3875  phosphate-selective porin-like  26.95 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  25.84 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  23.73 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  33.59 
 
 		 559 aa  67  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  27.07 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  23.57 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  24.17 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  23.41 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2060  phosphate-selective porin O and P  24 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  25.79 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  25.79 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  22.59 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  24.13 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>