162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0352 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  100 
 
 		 317 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  94.32 
 
 		 317 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  76.92 
 
 		 316 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  75.32 
 
 		 316 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  76.85 
 
 		 315 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  75.88 
 
 		 316 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  75.49 
 
 		 314 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  70.57 
 
 		 312 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  69.01 
 
 		 318 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  66.99 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  67.74 
 
 		 315 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  67.2 
 
 		 314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  60.92 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  61.73 
 
 		 329 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  60.92 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  60.92 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  62.27 
 
 		 333 aa  417  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  61.42 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  61.42 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  60.62 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  61.23 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  61.66 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  60.43 
 
 		 326 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  61.61 
 
 		 329 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  60.83 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  62.31 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  61.46 
 
 		 322 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  61.84 
 
 		 321 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  61.39 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  60.51 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  60.45 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  60.45 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  60.45 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  60.51 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  59.87 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  59.81 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  60.37 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  61.82 
 
 		 319 aa  394  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  60.96 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  57.76 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  53.44 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  47.63 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  45.99 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  51.28 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  52.65 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  35.94 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  41.97 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  37.25 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  38.57 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  35.63 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  40.74 
 
 		 540 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  41.22 
 
 		 577 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  33.13 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  34.04 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  35.76 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  33.89 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  36.47 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  34.34 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  31.19 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  29.17 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  30.39 
 
 		 154 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  27.85 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  30.63 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.68 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  30.73 
 
 		 658 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  29.95 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  35.56 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.11 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  31.11 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  28.84 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  28.91 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  32.06 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  26.76 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  26.64 
 
 		 658 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  28.64 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  34.4 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  28.83 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  28.95 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4570  hypothetical protein  55 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  28.08 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  28.08 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  31.01 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  27.22 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  25.63 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  25.93 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  26.9 
 
 		 156 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  32.89 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  28.79 
 
 		 154 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  29.01 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  28.79 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  27.35 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  30.77 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.38 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>