More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0119 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 		 328 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  92.99 
 
 		 328 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  89.63 
 
 		 328 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  85.06 
 
 		 328 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  80.79 
 
 		 327 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.88 
 
 		 327 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.57 
 
 		 327 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.57 
 
 		 327 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  79.57 
 
 		 327 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  78.96 
 
 		 327 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  78.66 
 
 		 327 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  78.05 
 
 		 327 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  77.74 
 
 		 327 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  75.91 
 
 		 327 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  71.65 
 
 		 328 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  60.18 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.37 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.94 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.2 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.44 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.54 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.8 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.8 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.23 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.32 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.49 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.79 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.49 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.06 
 
 		 331 aa  374  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  54.27 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.93 
 
 		 329 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.79 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.93 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.07 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.57 
 
 		 596 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  51.53 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  55.18 
 
 		 343 aa  340  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  50.92 
 
 		 357 aa  332  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  51.65 
 
 		 340 aa  328  6e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 		 336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.76 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.87 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.39 
 
 		 335 aa  291  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.46 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.04 
 
 		 342 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.53 
 
 		 345 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.41 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.41 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.41 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.45 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.73 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.78 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.42 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.76 
 
 		 343 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.92 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  45.59 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.76 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.02 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  46.87 
 
 		 365 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.45 
 
 		 344 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.45 
 
 		 343 aa  278  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.27 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.92 
 
 		 351 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.02 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.67 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.44 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.14 
 
 		 355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.32 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.24 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.07 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.35 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.24 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  46.04 
 
 		 354 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.9 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.02 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.78 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.94 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.76 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  43.98 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.25 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.03 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.45 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.45 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.06 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  42.64 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.15 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.65 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.9 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  40.49 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.85 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.14 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.77 
 
 		 326 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  43.47 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.46 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  40 
 
 		 340 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.68 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.2 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  38.79 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  43.08 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>