More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0115 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
158 aa  321  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.21 
 
 
163 aa  293  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.21 
 
 
163 aa  292  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.21 
 
 
163 aa  292  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0076  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.74 
 
 
158 aa  290  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.697492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  91.56 
 
 
163 aa  289  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4684  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.72 
 
 
163 aa  288  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0208  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.24 
 
 
168 aa  288  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.72 
 
 
163 aa  286  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  90.91 
 
 
158 aa  286  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0068  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.72 
 
 
163 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4331  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.05 
 
 
163 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4276  phosphopantetheine adenylyltransferase  92.05 
 
 
163 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  86.08 
 
 
168 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.61 
 
 
159 aa  280  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0110  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  87.1 
 
 
189 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.800905  normal  0.0383495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  75.97 
 
 
160 aa  249  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0213  phosphopantetheine adenylyltransferase  79.47 
 
 
156 aa  248  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00059  phosphopantetheine adenylyltransferase  76.62 
 
 
162 aa  247  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  70.86 
 
 
183 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  70.86 
 
 
159 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.87 
 
 
159 aa  220  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.42 
 
 
160 aa  219  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.21 
 
 
159 aa  220  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.76 
 
 
161 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.11 
 
 
159 aa  219  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.76 
 
 
159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.55 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.19 
 
 
159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  68.21 
 
 
159 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.21 
 
 
159 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4838  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.18 
 
 
161 aa  216  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000302126  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.52 
 
 
159 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2603  phosphopantetheine adenylyltransferase  69.08 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000855296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.87 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.87 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.87 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.87 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0163  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.58 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.94 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.29 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4385  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.88 
 
 
163 aa  210  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.87 
 
 
159 aa  209  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.91 
 
 
160 aa  209  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4095  phosphopantetheine adenylyltransferase  65.16 
 
 
159 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001814  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.58 
 
 
161 aa  206  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  62.34 
 
 
159 aa  205  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00659  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.23 
 
 
159 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2309  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.88 
 
 
164 aa  204  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2935  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.42 
 
 
167 aa  201  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0548  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  59.09 
 
 
164 aa  201  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  58.71 
 
 
170 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1930  coenzyme A biosynthesis protein  61.33 
 
 
160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0452277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.06 
 
 
170 aa  197  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  62.91 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  59.74 
 
 
169 aa  193  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.62 
 
 
165 aa  193  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.69 
 
 
165 aa  193  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.23 
 
 
162 aa  193  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3723  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.17 
 
 
164 aa  192  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.172497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.49 
 
 
168 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.49 
 
 
170 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.41 
 
 
165 aa  191  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.62 
 
 
160 aa  191  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.69 
 
 
174 aa  189  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0091  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  60.67 
 
 
163 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.84 
 
 
168 aa  187  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.55 
 
 
161 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.67 
 
 
167 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.67 
 
 
167 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3125  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.33 
 
 
160 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0748  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.82241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.33 
 
 
169 aa  185  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0469  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0564  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00247535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2925  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1497  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0093  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
166 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2725  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
165 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.284056  normal  0.758583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0494  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
165 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2867  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
165 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
168 aa  184  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0298  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  59.74 
 
 
159 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49145  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  58 
 
 
162 aa  183  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6137  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.55 
 
 
165 aa  183  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109378  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0580  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.19 
 
 
171 aa  183  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049418  normal  0.0168021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2818  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.55 
 
 
165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>