More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0087 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0211  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.26 
 
 		 696 aa  761    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001176  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.88 
 
 		 696 aa  820    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.29 
 
 		 699 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3988  flagellar biosynthesis protein FlhA  84.22 
 
 		 697 aa  1159    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.29 
 
 		 699 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.71 
 
 		 699 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.51 
 
 		 700 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.16 
 
 		 697 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.94 
 
 		 707 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6779  type III secretion FHIPEP protein  55.59 
 
 		 696 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.67 
 
 		 709 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.43 
 
 		 699 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4644  type III secretion FHIPEP protein  55.3 
 
 		 696 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207433  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04963  flagellar biosynthesis pathway, component FlhA  63.31 
 
 		 696 aa  834    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.06 
 
 		 697 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.51 
 
 		 710 aa  646    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0093  flagellar biosynthesis protein FlhA  88.6 
 
 		 693 aa  1227    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0163  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.51 
 
 		 696 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.33 
 
 		 709 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.37 
 
 		 705 aa  694    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0702  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.45 
 
 		 697 aa  799    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.628209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.22 
 
 		 699 aa  641    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3668  flagellar biosynthesis protein FlhA  83.41 
 
 		 693 aa  1108    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.29 
 
 		 699 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.29 
 
 		 699 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.98 
 
 		 699 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  58.15 
 
 		 697 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.22 
 
 		 700 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0622  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.75 
 
 		 698 aa  801    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 		 699 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 		 699 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.41 
 
 		 706 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0243  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.45 
 
 		 698 aa  796    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0111317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.13 
 
 		 699 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.71 
 
 		 703 aa  664    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.01 
 
 		 707 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.89 
 
 		 715 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  50 
 
 		 699 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  58.3 
 
 		 697 aa  795    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3485  flagellar biosynthesis protein FlhA  84.7 
 
 		 693 aa  1165    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.87 
 
 		 699 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.58 
 
 		 699 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3597  type III secretion FHIPEP protein  54.68 
 
 		 695 aa  743    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.69729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.59 
 
 		 724 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.82 
 
 		 698 aa  804    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.29 
 
 		 699 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0087  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 		 693 aa  1390    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.33 
 
 		 702 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 		 699 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.5 
 
 		 700 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.99 
 
 		 697 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.03 
 
 		 709 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.02 
 
 		 709 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.76 
 
 		 690 aa  625  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0274  type III secretion protein, FHIPEP family  54.97 
 
 		 579 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.807219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.03 
 
 		 748 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.14 
 
 		 699 aa  628  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.72 
 
 		 709 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0259  FHIPEP family type III secretion protein  54.8 
 
 		 579 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3378  type III secretion FHIPEP protein  54.8 
 
 		 579 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0263  protein FhiA  54.45 
 
 		 579 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00228  hypothetical protein  54.91 
 
 		 570 aa  618  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.34 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.58 
 
 		 709 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.01 
 
 		 755 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  47.74 
 
 		 696 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.4 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.69 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.49 
 
 		 708 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.56 
 
 		 693 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 		 684 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.67 
 
 		 699 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 		 684 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.49 
 
 		 708 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.01 
 
 		 694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.7 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.01 
 
 		 694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.24 
 
 		 693 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.04 
 
 		 693 aa  571  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.95 
 
 		 698 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.51 
 
 		 698 aa  561  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.54 
 
 		 692 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.23 
 
 		 695 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.85 
 
 		 695 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.25 
 
 		 693 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.14 
 
 		 697 aa  558  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  45.52 
 
 		 694 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.32 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.71 
 
 		 700 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.6 
 
 		 700 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.75 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.02 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 		 694 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>