More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0086 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 		 376 aa  769    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  72.87 
 
 		 376 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  72.07 
 
 		 376 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  70.48 
 
 		 376 aa  567  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  71.01 
 
 		 376 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  43.85 
 
 		 375 aa  332  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.51 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.6 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.57 
 
 		 378 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.05 
 
 		 374 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.3 
 
 		 378 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.57 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.43 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.02 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.61 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.01 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.36 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.89 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.09 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.63 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.43 
 
 		 376 aa  278  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.64 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.02 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.1 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.8 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.84 
 
 		 379 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.17 
 
 		 378 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.04 
 
 		 376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.38 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.74 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.27 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.12 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.12 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.12 
 
 		 376 aa  269  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.13 
 
 		 377 aa  268  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  40.42 
 
 		 374 aa  268  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.74 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 		 376 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.19 
 
 		 376 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.68 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.34 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.16 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.11 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.81 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.8 
 
 		 384 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.46 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.4 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.53 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.16 
 
 		 379 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  36 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.78 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.03 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.91 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.81 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.76 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.7 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.52 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.77 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.6 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.25 
 
 		 380 aa  239  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.82 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.96 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.31 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.23 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.69 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.69 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.96 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.96 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.93 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.39 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.39 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.39 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.39 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.69 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.89 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  33.7 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.13 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 		 399 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.81 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.86 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.81 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.05 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  36.81 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.78 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.62 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  36.81 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>