More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0083 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0083  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0089  flagellar biosynthesis protein FliP  83.47 
 
 		 242 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3664  flagellar biosynthesis protein FliP  83.06 
 
 		 243 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3984  flagellar biosynthesis protein FliP  81.07 
 
 		 244 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3481  flagellar biosynthesis protein FliP  79.42 
 
 		 244 aa  360  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  66.38 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  65.94 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3593  flagellar biosynthesis protein FliP  60.96 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  57.26 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  56.67 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  56.33 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  56.33 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  56.33 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  56.33 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  62.39 
 
 		 280 aa  254  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  55.98 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  57.08 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  54.58 
 
 		 253 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  54.84 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  55.88 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  54.8 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  54.94 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  58.11 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  55.93 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  55.93 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  55.93 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  58.64 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  54.88 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  55.93 
 
 		 248 aa  244  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  57.89 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  57.48 
 
 		 255 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  56.47 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  57.73 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4422  flagellar biosynthesis protein FliP  60.09 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  57.66 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  57.48 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  57.27 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  55.26 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  56.9 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  55.91 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  55.91 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  56.36 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  55.91 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  56.81 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  56.11 
 
 		 289 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  53.15 
 
 		 281 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  57.01 
 
 		 278 aa  238  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  51.67 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  56.07 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  56.07 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  53.91 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  51.25 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  51.25 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  51.25 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  57.97 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  55.02 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  54.67 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  57.97 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 276 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 276 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  57.97 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  57.4 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  54.42 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  57.42 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 276 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  53.56 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  53.56 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  51.95 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 		 253 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  50.93 
 
 		 261 aa  232  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  56.02 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  53.15 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  52.78 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  52.49 
 
 		 301 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  52.49 
 
 		 301 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  51.95 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  51.95 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  51.69 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  53.88 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  52.7 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  55.35 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  52.7 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  56.6 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  56.46 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  52.7 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  53.59 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  59.26 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  55.09 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  51.29 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  53.56 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  51.69 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  52.42 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>