256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0077 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  72.81 
 
 		 566 aa  865    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  62.28 
 
 		 558 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  61.9 
 
 		 565 aa  688    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 570 aa  1165    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  62.35 
 
 		 558 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  47.38 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  46.03 
 
 		 569 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  38.67 
 
 		 582 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4417  flagellar MS-ring protein  36.53 
 
 		 559 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.411819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0234  flagellar MS-ring protein  34.58 
 
 		 546 aa  306  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.151863  normal  0.235707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0711  flagellar MS-ring protein  34.58 
 
 		 546 aa  306  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.633063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0250  flagellar MS-ring protein  34.57 
 
 		 548 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0631  flagellar MS-ring protein  34.7 
 
 		 546 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 		 556 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3382  flagellar MS-ring protein  34.08 
 
 		 548 aa  300  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.275908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  33.79 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  32.3 
 
 		 592 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  33.68 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  32.13 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  31.67 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4655  flagellar MS-ring protein  36.55 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702143  normal  0.459158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  33.39 
 
 		 595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  32.71 
 
 		 594 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  33.22 
 
 		 594 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  32.07 
 
 		 592 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  32.7 
 
 		 594 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 		 568 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  31.46 
 
 		 558 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0171  flagellar MS-ring protein  33.14 
 
 		 551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  32.97 
 
 		 561 aa  260  6e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0223  flagellar MS-ring protein  32.63 
 
 		 532 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  29.87 
 
 		 544 aa  256  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  30.7 
 
 		 590 aa  256  8e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  32.62 
 
 		 544 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  32.61 
 
 		 567 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  31.71 
 
 		 552 aa  250  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.48 
 
 		 587 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.37 
 
 		 587 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  28.99 
 
 		 552 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.48 
 
 		 593 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.1 
 
 		 611 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.59 
 
 		 677 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  29.58 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  29.08 
 
 		 600 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  33.5 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  33.5 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  33.5 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.72 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.72 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 598 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 598 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  30.57 
 
 		 598 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 		 563 aa  226  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.76 
 
 		 567 aa  226  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  28.99 
 
 		 580 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  29.44 
 
 		 587 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.75 
 
 		 552 aa  224  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 		 552 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 		 552 aa  224  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 		 598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 		 598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 		 598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  30.39 
 
 		 598 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 		 552 aa  223  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 		 552 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  30.97 
 
 		 584 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  34.11 
 
 		 568 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  34.16 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  30.7 
 
 		 574 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  30.7 
 
 		 574 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  32.33 
 
 		 563 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  30.3 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  29.64 
 
 		 560 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.47 
 
 		 576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.8 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.8 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.8 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  31.07 
 
 		 594 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31.32 
 
 		 565 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 		 579 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  31.14 
 
 		 570 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  31.14 
 
 		 570 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  29.54 
 
 		 566 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  29.11 
 
 		 560 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  31.14 
 
 		 570 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  28.93 
 
 		 560 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  28.93 
 
 		 560 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  28.93 
 
 		 560 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  28.02 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30.33 
 
 		 533 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  28 
 
 		 580 aa  206  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  28.7 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.36 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2936  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 		 551 aa  203  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  29.73 
 
 		 561 aa  203  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  29.55 
 
 		 561 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  29.55 
 
 		 561 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>